為了能很好的進行醫療廢水處理或汙泥中的病原體或使之（zhī）滅活而進行的處理（lǐ）過程。分為廢水消毒和汙泥消毒。

　　醫院廢水處理主要是消毒，即殺滅病原體。提醒醫（yī）院廢水的（de）水質十分複雜，一般（bān）隨著用水量的加大，相應的汙染物濃度也越來越（yuè）高，醫院廢（fèi）水處理流程應盡可能設調節（jiē）池，調節（jiē）池不但可以調節水量，消滅高峰負荷，並可以調節水質，使其處理效果不會因水質變化而受到幹擾二氧（yǎng）化氯消毒（dú）劑的投（tóu）加點一般選擇在調節池（chí）之後。浮選沉（chén）澱後經消毒池(由二氧化氯（lǜ）混合發生器製備的消毒劑)進行消毒後，達標排（pái）放。自發浮選沉澱池的剩餘汙（wū）泥排入調節（jiē）池，調節池和接觸氧化池的汙泥打入汙泥消（xiāo）化池進行好氧（yǎng）消化處理可達標排（pái）放。

　　廢水經提升後進入混凝沉澱池進行混凝沉澱，沉澱池出水進入接觸池進行消毒，接觸池出水達標排放。調節（jiē）池、混凝沉（chén）澱池、接觸池的汙泥及（jí）柵渣等廢（fèi）水處（chù）理站內產生的垃圾集中消毒（dú）外運。

　　醫療廢水處理的基本方（fāng）法有三類：物（wù）理法和化（huà）學法。物理法主要是針對（duì）醫院廢水進行沉澱、分離等（děng）操作，這樣的操作並不能達到消菌的目（mù）的,但能為後續的消菌處理的（de）操作降汙染負荷。生化法是將廢（fèi）水和微生物混合與接觸，利用微生物自身發生的生（shēng）物化（huà）學等作（zuò）用對廢（fèi）水進行分解。